医院办公室组建于1984年，孙永臻为第一届院办公室主任，在数届主任的带领下，院办围绕健院的中心工作，负责保健院各院区日常行政、综合协调、国际合作与交流、对外拓展、公共关系、综合档案管理、公文处理、制度建设、重大事项督办等工作。2010年医院扩展业务面积，增设一院两址，同年组建东南院区综合办公室，负责协调、督导东南院区各项工作的正常运转，配合完成各类检查、参观接待、服务监督、投诉处理等工作。目前院办、东南院综合办各有工作人员3名。