预防保健科组建于1986年，主要负责辖区内围产保健，儿童体检及计划免疫接种，传染病防控,精神卫生保健，死亡监测等卫生服务工作。预防保健科现有医务人员15名，其中主治医师1名，主管医师4名，医师6名，主管护师2名及护师2名，主要业务内容围产保健、0~6岁儿童保健、计划免疫、传染病管理、精神卫生保健、健康教育等。预防保健科经过三十余年的发展,全科本着耐心、细心、爱心，全方位提供优质服务宗旨，管理着辖区内30个居委会12余万人口，11所幼儿园，11所中小学，近2万名学生及近3000名散居儿童体检及计划免疫工作。2010年12 月预防保健科成功创建了海淀区首家免疫规范化AAA门诊并定期接受考核，2017年在免疫规范化AAA门诊基础上创建了妇幼规范化AA门诊。2019年成为首批海淀区免疫预防服务新上岗人员实操培训基地。预防保健科一直以来重视管理，加强服务水平, 特别是2017年全面二胎政策实施后，工作要求越来越精细化，全方位考验防保科的各项工作。从孕产期保健、新生儿保健、散居儿童保健、儿童计划免疫、传染病管理及精神卫生等工作量陡増，但全科人员丝毫没有懈怠,在科室领导的带领下加强业务学习、耐心指导每位孕妇、细心呵护每位儿童、规范每项工作操作、专注每项工作任务。每年定期调查流动儿童进行查漏补种、强化免疫;对辖区外来务工人员进行流脑和麻疹疫苗接种;对中小学生及60岁以上老人进行流感接种；同时负责辖区内传染病防控监测工作。在2018年和2020年海淀区妇幼保健院优秀科室的评比中，预防保健科分别荣获优质服务先进集体奖和抗疫先进集体奖。2020年在中国女医师协会集体评选中评为最美抗疫团队。