小南庄社区卫生服务站隶属于海淀区妇幼保健院（海淀社区卫生服务中心），前身是原海淀万泉医院下属立新社区卫生服务站，坐落于立新社区。

2000年整合成立新的“立新社区卫生服务站”,站长为王洁荣。开展“六位一体”社区卫生服务工作。开设全科、中医针灸按摩、理疗、口腔等。
2006年12月份实行药品零差率销售。成立化验室，路静由全科医生岗位改任化验岗。
2007年7月王洁荣站长退休并返聘，常雪燕接任站长。全科门诊日均70~80人。
2008年5 ~ 8月政府对卫生站进行标准化建设，整体环境改善，刘新彦由护理岗位调任医保员管理岗位，负责社区医保各项工作。同年开展家庭保健员工作。

2009年甲流流行，需进行入户管理。站长常雪燕到看守所医疗中心支援工作1个月。海淀街道义工协会配合成立了 “海淀街道白衣天使服务队”。同年开展结核病患监化管理工作。

2010年由医院医保办、医务科等负责将“立新社区卫生服务站”改名为“小南庄社区卫生服务站”。口腔科刘燕医生退休，撤销口腔门诊。7月开始医保刷卡结算。
2011年5月开始基本公共卫生服务工作，医生工作站及社区卫生管理平台安装使用。同年开始控烟调查工作。

2012年外聘全科门诊张淑贤医生离职，医生减少，同时派出到120急救中心工作1人，全年门诊量达到3万人次，突显人员紧张。医保管理工作荣获北京市人社局及财政局颁发的一等奖。
2013年2月返聘王洁荣医生离职，包括站长在内只有两名全科医生承担门诊工作，日均门诊量达到130~150人次。
2014年4月份针灸按摩医生离职，针灸按摩业务停诊。开始规范门诊输液治疗，输液人数明显下降。
2015年招聘药房人员1人，各项工作更加规范并开展网上处方点评。全科门诊全年门诊量突破3万人次。开始老年人“一键式”家庭医生式服务工作、健康素养调查工作。医保管理工作荣获北京市人社局及财政局颁发的二等奖。
2016年医保管理工作荣获北京市人社局及财政局颁发的二等奖。
2017年全科两名医生全年门诊量达到3.6万人次，顺利完成医改工作， 完成政务云上线准备。

2021年10月20日完成站内重装改造，新建中医诊疗科室11间，划分中医全科、中医妇科和中医理疗三大诊区。